阿泰爾死了么?不，主角當(dāng)然不會(huì)輕易回老家結(jié)婚。當(dāng)他從沉睡中醒來(lái)后，他發(fā)現(xiàn)他的“死”其實(shí)是他導(dǎo)師所安排的的懲罰。艾爾?慕瓦林給了阿泰爾一個(gè)機(jī)會(huì)去重獲他的榮譽(yù)和尊嚴(yán)。

　　“這里有一份名單，他們都是給人民帶來(lái)災(zāi)難，帶來(lái)戰(zhàn)爭(zhēng)，令這個(gè)大陸腐朽，你所做的，就是找到他們，親手結(jié)束他們，并為人民帶來(lái)和平，而你，也將會(huì)從你的罪中解放出來(lái)”

　　“九個(gè)人的性命換我個(gè)人的贖罪……”

　　“你有問(wèn)題嗎?”

　　“只有從哪個(gè)人開(kāi)始而已”

　　接受了導(dǎo)師任務(wù)的阿泰爾踏上了刺殺之旅，他前往大馬士革，耶路撒冷和阿卡(Acre)追擊他的目標(biāo)，然而，當(dāng)他親手逐一結(jié)束他的目標(biāo)，他發(fā)現(xiàn)這份名單上的人，不完全是他導(dǎo)師所說(shuō)的那些給人民帶來(lái)災(zāi)難和戰(zhàn)爭(zhēng)的人，實(shí)際上，他們正在努力一起爭(zhēng)取某種和平。帶著疑問(wèn)的阿泰爾找到了他的導(dǎo)師，艾爾?慕瓦林告訴他，這些人其實(shí)都是羅伯特身邊的圣殿騎士，他們都在密謀建立一個(gè)“新世界”。

　　而之前阿泰爾到所羅門(mén)神殿去奪取的財(cái)寶，正是這個(gè)計(jì)劃所需要的關(guān)鍵物品：伊甸的蘋(píng)果。蘋(píng)果的能力可以讓使用者操縱其他人，如果圣殿騎士得到它，他們將會(huì)用蘋(píng)果的力量控制整個(gè)地中海甚至更遠(yuǎn)的地方，實(shí)現(xiàn)他們所制定的和平。而防止圣殿騎士邪惡野心的達(dá)成正是阿泰爾刺殺這九個(gè)人的最終目的。艾爾?慕瓦林的這番話給了阿泰爾更微妙的想法，他開(kāi)始為他以前的行動(dòng)，為他的魯莽，為他的傲慢而感到懊悔，而他也強(qiáng)烈地意識(shí)到他自己作為一個(gè)刺客應(yīng)有的責(zé)任——他應(yīng)該為教團(tuán)和地中海的自由負(fù)責(zé)甚至奉獻(xiàn)其生命。

　　此時(shí)的暗殺名單上，等待著阿泰爾的就只剩下他的老朋友：圣殿騎士團(tuán)長(zhǎng)羅伯特。阿泰爾尾行他的蹤跡到耶路撒冷，此時(shí)的羅伯特正在參加阿泰爾之前所殺騎士馬吉德?阿丁(Majd Addin)的葬禮。對(duì)于刺客來(lái)說(shuō)，這種人多**的地方簡(jiǎn)直就是暗殺者的天堂，心中暗喜的阿泰爾隱藏在人群中準(zhǔn)備趁機(jī)行事。然而羅伯特并沒(méi)有他所想象的那么愚蠢。當(dāng)阿泰爾踏進(jìn)葬禮會(huì)場(chǎng)，埋伏好的士兵突然出現(xiàn)并開(kāi)始攻擊阿泰爾。

　　幸好阿泰爾的強(qiáng)大技術(shù)讓他化險(xiǎn)為夷，逐一將士兵擊破后，阿泰爾來(lái)到了羅伯特面前，然而他發(fā)現(xiàn)這一切沒(méi)那么就簡(jiǎn)單，這個(gè)羅伯特只不過(guò)是由一個(gè)叫瑪利亞?索普(Maria Thorpe)的女騎士所扮演。在瑪麗亞爭(zhēng)取的這段時(shí)間里，真正的羅伯特現(xiàn)在已經(jīng)到達(dá)阿爾蘇夫(Arsuf)并開(kāi)始聯(lián)合伊斯蘭教徒和十字軍一起對(duì)兄弟會(huì)發(fā)起攻擊，被擺了一道的阿泰爾已經(jīng)無(wú)心理會(huì)瑪麗亞的事情——對(duì)于現(xiàn)在的他來(lái)說(shuō)，沒(méi)有比兄弟會(huì)安危更重要的事。饒恕了瑪麗亞的阿泰爾馬不停蹄地把這個(gè)消息告訴了馬里克，并要求其調(diào)查所羅門(mén)神殿的真相，然后獨(dú)自背負(fù)著沉重的壓力前往了阿爾蘇夫，因?yàn)閷?duì)于他來(lái)說(shuō)，此行成敗決定了兄弟會(huì)的未來(lái)……

　　阿泰爾深陷埋伏，然而這個(gè)地方對(duì)于阿泰爾來(lái)說(shuō)也別有一番意義，因?yàn)樗谶@里，他遇到了他一生的摯愛(ài)

　　匆匆忙忙趕到達(dá)阿爾蘇夫戰(zhàn)場(chǎng)的阿泰爾發(fā)現(xiàn)伊斯蘭教徒和十字軍已經(jīng)開(kāi)始行動(dòng)，留給他的時(shí)間已經(jīng)不多。阿泰爾一路殺到前線并來(lái)到了獅心王——理查德國(guó)王(Richard I of England)的營(yíng)地。阿泰爾在國(guó)王面前揭露羅伯特的陰謀，羅伯特否認(rèn)這一切的指控，由于無(wú)法辨別哪方為真，國(guó)王選擇把決定權(quán)留給上帝，賜予他們二人決斗的權(quán)力，勝者的話就為真理。這次再也沒(méi)有犯錯(cuò)的阿泰爾親手把刀刃放在了羅伯特的脖子上，臨死的羅伯特告訴了阿泰爾一個(gè)他這輩子最震驚的秘密，他的導(dǎo)師艾爾?慕瓦林事實(shí)上是個(gè)騎士。艾爾?慕瓦林通過(guò)阿泰爾的手，除掉名單上的九個(gè)人，并獨(dú)占伊甸的蘋(píng)果。

　　“你根本一無(wú)所知阿泰爾，你只不過(guò)是艾爾的扯線木偶罷了。他耍了你，就像他耍了我們一樣!”

　　在獅王心中，阿泰爾在理查德國(guó)王面前與羅伯特對(duì)峙

　　如同晴天霹靂的阿泰爾得到了理查德國(guó)王的寬恕，匆忙地趕回邁斯亞夫希望得到真相。但當(dāng)他回到家鄉(xiāng)，他發(fā)現(xiàn)一切都變得不妥，村民被洗腦，認(rèn)為艾爾?慕瓦林的領(lǐng)導(dǎo)能把他們帶到光明的未來(lái);而城堡周圍的刺客更開(kāi)始向他攻擊。雖然阿泰爾技術(shù)了得但面對(duì)如潮水一般的敵人，他慢慢也感覺(jué)力不從心。就在這關(guān)鍵時(shí)刻，馬里克帶著未被控制的刺客及時(shí)到來(lái)并與阿泰爾共同作戰(zhàn)。留下馬里克和其他刺客善后，阿泰爾獨(dú)自踏進(jìn)邁斯亞夫的城堡。

　　得知了一切陰謀的阿泰爾與自己的導(dǎo)師展開(kāi)了最終對(duì)決

　　城堡的主人此時(shí)正在花園默默地等待著他的愛(ài)徒，當(dāng)然，還有他的武器，伊甸的蘋(píng)果。他向阿泰爾解釋蘋(píng)果的能力是可以去控制其他人的內(nèi)心，通過(guò)這個(gè)能力的指引下，人類才能得到絕對(duì)的和平。然而這番話卻已經(jīng)偏離刺客之道，為了清理門(mén)戶，為了貫徹刺客的信條，阿泰爾揮刀向自己曾經(jīng)的導(dǎo)師砍去。

　　盡管阿泰爾能抵抗部分蘋(píng)果的影響，但艾爾還是放出了自己和之前已經(jīng)被阿泰爾殺死的九個(gè)圣殿騎士的幻影并開(kāi)始攻擊阿泰爾。然而經(jīng)歷了這一切的阿泰爾無(wú)論心身都變得更加強(qiáng)大，并最終擊倒了他的導(dǎo)師。在他臨死前，艾爾說(shuō)阿泰爾不會(huì)去毀滅蘋(píng)果，因?yàn)樗哪歉呱械男牟粫?huì)允許他這樣做。與此同時(shí)，從艾爾手中滑落的蘋(píng)果投射出一個(gè)全息圖像，面對(duì)如此外星的科技，眾人除了目瞪口呆也無(wú)從下手，然而他們想不到的是，這張地圖的標(biāo)記代表著所有伊甸碎片的存放位置……(以上來(lái)自《刺客信條 1》的游戲故事)

　　蘋(píng)果投射出了所有伊甸碎片的位置，爭(zhēng)奪碎片的戰(zhàn)爭(zhēng)，從此打響