孤島驚魂是個多結(jié)局游戲，玩家在游戲的最后會有兩個選擇，這個需要玩家自行體驗，對于通關(guān)了的玩家可以參考一下下文的不同結(jié)局解析，建議玩家親自體驗一下這款游戲的兩個結(jié)局。

　　結(jié)局不同選擇

　　主角殺死大反派后，跟弟弟回到斯特拉那兒，結(jié)果被迷魂香(或是別的啥玩意兒)弄暈了。醒來后發(fā)現(xiàn)自己被斯特拉綁起來了，斯特拉向主角表白：她愛上了主角，于是便讓主角走上戰(zhàn)士之路。

　　主角在斯特拉走后自己解開了綁自己雙手繩子，開始走上了戰(zhàn)士之路。在戰(zhàn)士之路上，出現(xiàn)了許多火焰莉莎、巨人莉莎的畫面，應(yīng)該是斯特拉為了讓主角留下而在主角的戰(zhàn)士之路詆毀莉莎，讓主角認(rèn)為莉莎便是那強(qiáng)大的巨人。

　　走過戰(zhàn)士之路后，主角拿起明朝古刀，就轉(zhuǎn)到處決莉莎的畫面。

　　選擇 【救下朋友】，主角打破了幻覺，恢復(fù)了一些理智，并沒殺死莉莎，而是把綁莉莎的繩索割開。并說道：這些罪行結(jié)束了，我不干了，不能再讓人流血了!斯特拉看到主角這樣做，再一次表白說自己愛主角。結(jié)果，丹尼斯大叔出現(xiàn)，羨慕嫉妒恨(之前的任務(wù)，他說幸虧斯特拉收留他，那時候他還喝了不少酒，原來是個吊絲，好像還很喜歡斯特拉)地說到：杰森，你是怎么回事!?斯特拉她救了我，救了所有人，而你卻拒絕她的愛(這才是真愛啊，為了讓自己所愛的人幸福，忍心把自己所愛給別人)，啊!?(說完就用刀捅向主角)接著斯特拉沖過來擋了這致命的一刀，斯特拉又一次深情地表白道：我愛你，別離開我……主角低聲說了句“我很抱歉”之后斯特拉就死了。這是丹尼斯后悔道：我都做了什么、我都做了什么，斯特拉，求你了，別走……斯特拉，對不起，別走啊(都哭出來了)，求求你了!(唉，所愛之人不早些表白，等晚了之后才…這時候，丹尼斯錯殺了女王斯特拉，即使丹尼斯不會以死謝罪，羅克亞特的人們也不會放過他的)過了一段動畫后，主角很有哲理的說到：我殺了不計其數(shù)的人，我不能就這樣的回去，我是個怪物，我依然能感覺到身體中的憤怒，但是，我還是，在心中的某些東西，比憤怒更好，還更多。接著主角的朋友們都開船走了，主角則留在島上繼續(xù)冒險，斯特拉、丹尼斯、主角朋友以后不會出現(xiàn)，神廟也不會再打開，而主線任務(wù)也不會再有了。

　　選擇 【加入斯特拉】，主角受幻覺蠱惑，認(rèn)定女友莉莎是巨人，并割了女友的喉，女友跟其他朋友，包括自己的弟弟萊利都死亡了……接著出現(xiàn)主角跟斯特拉交配的畫面(眾目睽睽啊!)，結(jié)果沒幾秒就射了，射之前，斯特拉告訴主角：主角會成為羅克亞特的王，所有的人都會效忠于他(哎?丹尼斯這個吊絲跑哪去了!)。主角射完后，已經(jīng)沒有余力了，被斯特拉用明朝古刀砍中腹部，瀕臨死亡，斯特拉說：主角和她的孩子將來會成為羅克亞特的王，主角是一名戰(zhàn)士，死也要像個戰(zhàn)士(這就是主角死的原因，主角是個戰(zhàn)士，不能像個普通人一樣病死，而斯特拉也明白主角有主角光環(huán)，不可能在正常情況下死亡，于是趁著主角虛弱之時，用刀砍死主角，讓主角死也像個戰(zhàn)士一樣)，你…贏了。說完主角倒下。后來按enter，主角沒死，只是暈了，斯特拉不再見主角，神廟大門永遠(yuǎn)關(guān)閉，丹尼斯不知所向，主線任務(wù)消失。